آیت‌الله سید احمد خاتمی در گفت‌وگو با ایسنا در مورد عمل منفور قرآن‌سوزی در آمریکا گفت: انا لله و انا الیه راجعون. اهانت به قرآن کریم داغ سنگینی است که باید این مصیبت را به محضر حضرت بقیه‌الله الاعظم حجت ابن الحسن ارواحنا لتراب مقدمه الفداه که قرآن ناطق و صاحب قرآن است تسلیت گفت.
وی افزود: این جنایت جلوه‌ای از جنگ صلیبی است که مدت‌هاست دشمنان اسلام آن را آغاز کرده‌اند و بدون تردید در این جنگ، بازنده آنها هستند و خواهند دید که توان مقاومت در برابر نور گسترده و رو به افزایش اسلام را ندارند.
این عضو مجلس خبرگان رهبری اظهار کرد: این حرکت خود نشانه‌ی دیگری است از خیزش جهانی اسلام که کینه‌ی خود را این‌چنین در این جنایت به نمایش می‌گذارند و بایستی اوباما و هیات حاکمه‌ی آمریکا در این زمینه پاسخگو باشند؛ زیرا این جنایت در حوزه‌ی جغرافیایی کشور آنها صورت گرفته و هیچ عذری در این رابطه پذیرفته نیست.
خاتمی گفت: امیدواریم جهان اسلام با خروش جهانی خود علیه این جنایت، جنایتکاران و آنانی که جنایت را در خیال خود دارند و فکر می‌کنند می‌توانند با اسلام عزیز مقابله کنند را از رفتار خود پشیمان کرده و با این خروش خود به جهانیان این پیام را بدهند که «ای مگس عرصه‌ی سیمرغ نه جولانگه توست، عرض خود می‌بری و زحمت ما می‌داری».

هنداباد خبر نیز این حاثه دلخراش و سوزناک را به مسلمانان جهان تسلیت عرض می نماید و خواستار واکنش همه اسلامیان در سراسر جهان هستی می باشد .